Le Zoo de La Chaux-de-Fonds s'efforce de suivre les missions de l'Association Européenne des Zoos et Aquariums (EAZA).

- divertissement (moment de détente en plein air dans le parc, observation des animaux, activités pour les enfants à la place de jeux)

- conservation d'espèces menacées (station de soins pour animaux sauvages, programme de reproduction d'espèces menacées : Loutre d'Europe, Lynx d'Europe et bientôt Crocodile nain d'Afrique)

- éducation à l'environnement (expositions et animations sur la faune, visites guidées: passeports vacances, anniversaires)

- recherche scientifique (via le Musée d'histoire naturelle et des collaborations avec les Universités et d'autres organismes nationaux ou régionaux)

L'entrée du Zoo est gratuite. Vos dons sont les bienvenus, vous trouverez des tirelires à plusieurs endroits dans le Zoo (vers l'entrée au Sud, à l'intérieur du vivarium et près de l'enclos des lynx)